史书中关于青瓦台周边地区的最早记录出现在高丽肃宗时期的1104年左右。
高丽将开京（现在的朝鲜开城）、西京（平壤）和东京（庆州）设为三京，肃宗在位时期，选择在推测为青瓦台周边地区的位置建立了离宫，取代东京成为南京。 南京的意思是“南方的首尔”。
南京王宫布局推测复原图
- 景福宫图国家遗产局，《照片中的景福宫》，2006年，75版全部
- 景福宫图朝鲜英祖43年（1767年）之后，收藏于首尔历史博物馆收藏
- 景福宫全图朝鲜英祖43年（1767年）之后，收藏于首尔三省出版博物馆
Site of a secondary palace景福宫建成
李成桂建立朝鲜后，在讨论迁都问题时再次出现了关于青瓦台周边地区的记录。1394年，官员们向君王谏言称，如果将高丽肃宗时期的离宫用作新宫殿则面积太小，所以建议南下建造宫殿。于是，太祖于同年12月开始修建宫殿，次年9月景福宫完工。壬辰倭乱爆发之前，朝鲜的君王大多居住在景福宫，今天的青瓦台一带曾是君王与大臣们在天地神明面前祭祀，宣誓忠诚与团结，不定期举行会盟仪式的场所。《实录》等书中记载的该时期的景福宫后苑（又名禁苑或上苑）位于今天距离青瓦台很近的景福宫北侧的围墙内。
景武台
1592年壬辰倭乱爆发，景福宫彻底变成了废墟，被弃置了约270年，高宗2年（1865年）得以重建。当时在景福宫的神武门外，如今青瓦台所在的地区建造了许多用途不同的建筑。从 1868年开始，此处陆续建起了曾作为科举考场的隆文堂、进行军事训练隆武堂以及五云阁、玉莲亭、庆农斋等建筑。自1869年起，隆文堂和隆武堂一带被称为景武台。进入日本帝国主义强占时期后的1929年，朝鲜总督府为了纪念日本统治20周年，在景福宫和景武台旧址举办了朝鲜博览会，大部分建筑被拆除。1929年朝鲜博览会结束后，这里曾一度成为一片空地，日本帝国主义于1939年在此处建造了朝鲜总督官邸。
从景武台到青瓦台
1945年光复后，总督官邸建筑被用作美军政司令官的官邸，1948年大韩民国政府成立后交给了政府。此后，李承晚总统夫妇将住处从梨花莊搬到了景武台，将1楼用作办公室，2楼用作官邸。包括本馆在内，此处沿用旧地名，依然叫做景武台，成为当时大韩民国国政的中心空间。1960年上任的尹潽善总统认为，国民对景武台这个名字的印象不是很好，于是从1961年起改名为青瓦台，因为这里的建筑用的都是青瓦。
全面开放
朴正熙总统在任时期，随着经济的增长，青瓦台的秘书职能与机构得到扩大。此后，随着建筑物的维修和扩建，新建了常春斋和迎宾馆等，青瓦台内部的结构发生了巨大的变化。到了卢泰愚总统在任时期，他决定新建一座与韩国的地位和民主主义时代相匹配的具有光明和进取意义的青瓦台，于是在1990年新建了现在的官邸和春秋馆，1991年新建了本馆。1993年，按照金泳三总统的指示，拆除了日本帝国主义强占时期建造的旧本馆建筑。此后，金大中、卢武铉、李明博、朴槿惠和文在寅总统相继在本馆中办公。2022年上任的尹锡悦总统将办公室和官邸迁至龙山，从此青瓦台全面向民众开放。